Transcriptomique et génomique Marseille Luminy (TGML)
Séquençage à haut débit, puces à ADN et analyse de données dans le domaine de la génomique.
Transcriptomique et génomique Marseille Luminy (TGML)
Séquençage à haut débit, puces à ADN et analyse de données dans le domaine de la génomique.
Transcriptomique et génomique Marseille Luminy (TGML)
Composante de l’infrastructure distribuée France Génomique, la plateforme TGML est intégrée au laboratoire Théories et approches de la complexité génomique (TAGC) de l’Inserm et de l’Université Aix-Marseille. Accessible aux équipes de recherche publique en France et à l'étranger, ainsi qu’aux industriels, elle offre une large palette d’outils expérimentaux et bioinformatiques pour l’étude du transcriptome et de la génomique fonctionnelle. Ses ingénieurs assurent le traitement et l’analyse de puces à ADN, la construction de librairies, le séquençage et les analyses de données (primaires et secondaires). Les activités de TGML sont certifiées ISO 9001 et NF X50-900. Le système de management de la qualité concerne l’expertise, la recherche et le développement, en génomique et bioinformatique en sciences du vivant.
Expertises et services
- Construction de librairies de séquençage ChIP-Seq,
- Construction de librairies de séquençage RNA-Seq : sélection poly(A) et ribo-déplétion,
- Construction de librairies de séquençage miRNA-Seq,
- Construction de librairies avec le Chromium Controller : single cell et linked reads,
- Séquençage,
- Réalisation et analyse de puces à ADN : ARN total et petits ARNs,
- Réalisation d’analyses bioinformatiques.
Moyens et équipements
- Séquenceur NextSeq 500 (Illumina),
- Automate de microfluidique Chromium Controller (10x Genomics),
- Scanner microarray (Agilent),
- Robots pipeteurs EVO 150 (Tecan) et Appolo 324 (WaferGen),
- Quantité et qualité : Qubit (LifeTechnologies), NanoDrop (Thermo Fisher Scientific), Fragment Analyzer (Advanced Analytical),
- Cluster de calcul : 18 nœuds, 288 cœurs, 1.5 To de RAM et baie GPFS de 220 To pour le stockage des données.
Comment soumettre un projet ?
Pour soumettre un projet à Transcriptomique et génomique Marseille Luminy (TGML), envoyez un mail à l’adresse tgml.tagc@inserm.fr ou remplissez le formulaire en ligne mis à votre disposition sur le site internet de la plateforme.
Contact
TGML
Bâtiment TPR2, niveau -1
163 avenue de Luminy
13288 Marseille
Région : Provence-Alpes-Côte d'Azur
+33 (0) 4 91 82 87 13
tgml.tagc@inserm.fr
Site de la plateforme
THÉMATIQUES : Bioinformatique, bases de données, Génomique, transcriptomique
RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Béatrice Loriod
RESPONSABLES TECHNIQUES :
Béatrice Loriod
RESPONSABLES QUALITÉ :
Béatrice Loriod
CERTIFICATIONS :
TUTELLES : Aix-Marseille Université, Inserm
INFRASTRUCTURES NATIONALES : France Génomique
LABELLISATION IBiSA : 2008
MOTS CLÉS : Séquençage à haut débit, NGS, Puces à ADN, ARN, ADN, Bioinformatique, Génomique, Transcriptomique, Single cell
Fiche mise à jour en 2021
