Quantum efficiency Strasbourg (QuESt)

La plateforme QuESt est constituée par les plateformes d'imagerie de l'IGBMC (ICI) et de la Faculté de pharmacie de l’Université de Strasbourg (PIQ). Elles sont toutes les deux gérées par des coordinateurs scientifiques et techniques et un comité de pilotage. Leurs ingénieurs hautement qualifiés assurent aux utilisateurs un accès à des techniques d’imagerie avancées et à leur développement : microscopie confocale et multiphotonique, à feuille de lumière, super-résolue, STED et PALM, électronique à balayage et à transmission…

Des formations permettent aux utilisateurs d’accéder de manière autonome à un grand nombre de systèmes et d’expertises en imagerie, logiciels de traitement et d'analyse d'images. Cet accès est autorisé après étude du projet (pour les externes) et/ou à l'aide des systèmes de réservation en ligne (pour les internes). La formation pluridisciplinaire des ingénieurs (physique, optique, biologie cellulaire et du développement, chimie, informatique et traitement d'images) facilite les interactions avec les chercheurs de différents horizons et permet de mener de nouveaux développements instrumentaux et méthodologiques en interaction avec des laboratoires de recherche publics et privés.

Expertises et services

• Microscopie photonique : champ large, confocal, spinning disk, super-résolution, feuille de lumière,
• Traitement et analyse d’images,
• Immunomarquage d’échantillons,
• Transparisation d’échantillons,
• Culture cellulaire.

Moyens et équipements

Microscopes confocaux et biphotons (PIQ, ICI) :

• Leica SPE inversé (PIQ),
• Leica SP5 inversé avec chambre environnementale et laser multiphoton (680 - 1080 nm) pour l’imagerie multiphoton et la photoablation (ICI),
• Leica SP5 droit avec chambre environnementale et laser multiphoton (680 - 1080 nm) pour l’imagerie multiphoton (ICI),
• Leica SP8-X inversé avec chambre environnementale (ICI),
• Leica SP8-UV inversé pour expériences de photoablation, uncaging, dommages ADN et photoactivation (ICI),
• Leica SP8-MP droit avec chambre environnementale et laser multiphoton (690 - 1080 nm) pour l’imagerie multiphoton, intravitale, la photoablation et SHG (ICI),
• Olympus IX70 à excitation multiphoton (680 - 1300 nm) avec chambre environnementale et optimisé pour des expériences de FLIM-FRET et FCS (PIQ),
• Nikon Ti-E à excitation IR (980 nm) de forte puissance et multiphotonique (720 - 920 nm) optimisé pour la microscopie à conversion ascendante de photons et le FLIM-PLIM (PIQ).

Microscope à feuille de lumière (PIQ, ICI) :

• Leica Digital Lightsheet (ICI) pour les petits échantillons (2 mm),
• Microscopie à nappe de lumière (PIQ) en association à de l’imagerie super-résolutive PALM/STORM.

Microscopes confocaux spinning disks (ICI) :

• Yokogawa CSU-W1 (Leica DMi8) avec chambre environnementale, module FRAP, TIRF 360° et super-résolution Live-SR,
• Yokogawa CSU-X1 (Nikon TiE) avec chambre environnementale, module FRAP, photoablation et super-résolution Live-SR.

Vidéomicroscopes (PIQ, ICI) :

• Leica DMIRE pour l’imagerie de cellules vivantes en fluorescence avec possibilité de microinjection (PIQ),
• Till Photonics iMIC pour l'imagerie multimodale (FRAP, photodommage, TIRF 360°, optogénétique) en champ large (PIQ),
• Zeiss Axio Observer Z1 pour l’imagerie de cellules vivantes en fluorescence (ICI).

Microscopes à champ large et épifluorescence (ICI) :

• 4 microscopes droits pour la fluorescence et le champ clair,
• 2 microscope inversés pour la fluorescence et le champ clair,

Macroscopes (ICI) :

• Macroscope Leica à champ clair et épifluorescence,
• Macroscope Leica M420 à champ clair,
• Macroscope Leica confocal pour grands échantillons.

Microscopes de super-localisation (PIQ) :          

• Nikon TI-E pour l’imagerie de super-résolution multicouleur (PALM/dSTORM) avec 3D par optique adaptative,
• Olympus IX81 pour l’imagerie de super-résolution spectrale (spectral PAINT),
• Olympus IX71 pour le suivi de particules uniques en plein champ et l’imagerie champ large à conversion ascendante de photons.

Microscope à force atomique (PIQ) :

• Veeco Multimode, Nanoscope III.

Microscope à microdissection (ICI) :

• Microscope Zeiss inversé Axio Observer Z1 avec module PALM MicroBeam de microdissection et chambre environnementale.

Culture cellulaire et préparation des échantillons (PIQ, ICI) :

• 3 salles équipées avec PSM de niveau 2 et incubateurs (PIQ, ICI),
• Plasma cleaner et UV-ozone (PIQ), sorbonnes (PIQ, ICI).

Traitement et analyse des données (PIQ, ICI) :

• 6 stations de travail équipées des logiciels Fiji, CellProfiler, Icy, QuPath, Metamorph (ICI), Imaris (ICI, PIQ), Matlab, SIMFcs, Autoquant (PIQ).

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre un projet à la plateforme QuESt, envoyez un mail à l’adresse générique groupe-mic-photon@igbmc.fr. Décrivez brièvement votre projet et la technique d’imagerie que vous souhaitez mettre en œuvre. L’équipe de la plateforme vous recontactera pour étudier avec vous la faisabilité du projet, la meilleure stratégie d’imagerie à utiliser et la nature des services que QuESt peut vous offrir. Une réponse vous sera adressée dans les deux semaines suivant la demande. Le délai nécessaire à la réalisation des projets varie selon le type de service sollicité.

Contact

QuESt
Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC)
1 rue Laurent Fries, BP10142
67404 Illkirch-Graffenstaden
Région : Grand Est+33 (0)3 88 65 51 27
vernayb@igbmc.fr
Site de la plateforme

 

THÉMATIQUES : Biologie structurale, biophysique, biochimie, Histologie, anatomopathologie, Imagerie cellulaire, Imagerie in vivo, radiobiologie

RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Philippe Rondé (PIQ), Juliette Godin (ICI)

RESPONSABLES TECHNIQUES :
Ludvic Richert (PIQ), Bertrand Vernay (ICI)

TUTELLES : CNRS, Inserm, Université de Strasbourg

LABELLISATION IBiSA : 2013

MOTS CLÉS : Super-résolution 3D, PALM/STORM, Live-SR, FLIM-FRET, PLIM, Imagerie multi-échelles, Microscopie corrélative, Feuille de lumière, Multiphoton, TIRF, HiLo, Transparisation, Confocal à disque rotatif, Spinning disk confocal, Traitement et analyse d’images, Microscopies confocales, FCS, FRAP, Microscopie à molécules uniques, Micro-injection, Microscopie du vivant, Microscopie à conversion ascendante de photons, Microscopie à force de traction

Fiche mise à jour en 2021

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