PRISMM

PRISMM est une plateforme universitaire de l’unité de service PLATON spécialisée dans le domaine de l’exposome. Elle met en œuvre des approches ciblées, semi-ciblées et non ciblées pour la quantification ou l’identification de biomarqueurs de faible poids moléculaire (< 2000 g/mol) par des techniques de chromatographie couplées à la spectrométrie de masse. Une partie importante des analyses réalisées sur la plateforme sont en lien avec des expositions professionnelles et environnementales. A ce titre, PRISMM participe à l’étude de l’exposome et possède une capacité à traiter un grand nombre d’échantillons. La plateforme recherche également les biomarqueurs d’effets biologiques associés à ces expositions. En outre PRISMM met en œuvre des dosages de biomarqueurs métaboliques pour des équipes de recherche dans le domaine de l’oncologie, des neurosciences, de l’endocrinologie, des sciences du médicament et de l’environnement.

Expertises et services

• Développement, validation et mise en œuvre de méthodes de dosage de différentes familles de biomarqueurs dans des matrices complexes humaines, animales et environnementales,
• Dosage de biomarqueurs d’exposition : traces de pesticides et métabolites dans les urines, traces de pesticides dans des patchs en coton, traces d’anticancéreux dans le sang et xénobiotiques dans les fluides biologiques (suspect screening),
• Dosage de biomarqueurs d’effets : adduits à l’ADN et marqueurs épigénétiques dans les tissus et globules blancs, stéroïdes biogéniques dans le sang et les cultures cellulaires, cortisol et DHEA dans la salive, neurotransmetteurs dans le cerveau et le plasma,
• Réalisation d’études métabolomiques non ciblées dans différentes matrices biologiques,
• Dosage de principes actifs dans sang, le cerveau, le LCR et le cœur pour des études pharmacocinétiques,
• Conseil pour l’échantillonnage, l’extraction, la préparation, la conservation des échantillons, l’analyse, le calcul et le rendu des résultats,
• Synthèse de polymères imprimés.

Moyens et équipements

• UHPLC-MS/MS triple quadripôle Sciex 7500 QTRAP,
• UHPLC-HRMS/MS QTOF Sciex X500R,
• SBSE-(Py)-GC-MS/MS RIC technologies,
• Spectromètre de masse Agilent 6495 avec module d’extraction en ligne,
• Système UHPLC-UV-MS/MS triple quadripôle Shimadzu 8040,
• 2 automates Hamilton Microlab STARlet avec modules d’extraction à pression positive pour la préparation des échantillons,
• Matériel d’extraction, centrifugeuses et évaporateurs,
• Stations de retraitement haute performance au sein d’un réseau informatique sécurisé pour les analyses métabolomiques et le suspect screening,
• Stockage sécurisé de grande capacité pour la conservation des données.

Comment soumettre un projet ?

Pour toute demande de prestation ou de collaboration avec PRISMM, un formulaire à remplir est à votre disposition sur le site web de la plateforme. Ce document permettra d’évaluer la faisabilité de votre projet et de prendre connaissance des conditions expérimentales. Une réponse vous sera apportée dans un délai d’une semaine maximum. Si votre demande ne correspond pas aux rubriques du formulaire, ou pour toute demande d’information complémentaire, vous pouvez également contacter la plateforme par mail à l’adresse contact.prismm@unicaen.fr.

Exemple d'utilisation

Effets des activités professionnelles agricoles sur la stabilité génomique au sein d’une biobanque d’agriculteurs

L’agriculture et les expositions professionnelles aux pesticides sont régulièrement associées à la survenue de cancers. L’amélioration des mesures d’exposition et l’analyse des mécanismes biologiques impactés par les pesticides sont indispensables pour explorer ces liens. Une approche d’épidémiologie moléculaire a été mise en place pour quantifier les dommages et valider la causalité mise en évidence par l’épidémiologie classique.

Dans le cadre d’une collaboration avec l’Inserm, la plateforme PRISMM a analysé les adduits à l’ADN formés à partir de 8 aldéhydes issus de la peroxydation lipidique, et les niveaux de marqueurs épigénétiques d’ADN total de granulocytes. Ces deux familles de biomarqueurs peuvent résulter d’un stress oxydatif ou de modifications épigénétiques consécutives à une activité agricole. Leur dosage a été réalisé sur plus de 1 000 échantillons de la biothèque EPIBIO97, grâce à la mise au point d’outils méthodologiques dédiés. Les niveaux de ces biomarqueurs d’effets ont ensuite été associés aux caractéristiques des individus étudiés.

Pour en savoir plus : Vandoolaeghe Q. et al. (2025). Comparison of PGC and Biphenyl stationary phases for the high throughput analysis of DNA epigenetic modifications by UHPLC-MS/MS. Journal of Chromatography B, 1250:124382.

Contact

PRISMM
Centre François Baclesse
3 avenue du général Harris, BP 5026
14076 Caen Cedex 5
Région : Normandie+33 (0)2 31 56 82 51
contact.prismm@unicaen.fr
Site de la plateforme

THÉMATIQUES : Métabolomique, exposome, Autres

RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Raphaël Delépée

RESPONSABLES TECHNIQUES :
Valérie Bouchart

TUTELLES : Université de Caen Normandie

LABELLISATION IBiSA : 2022

MOTS CLÉS : Épidémiologie moléculaire, Exposome chimique, Métabolome, Suspect screening, Humain, Animal, Spectrométrie de masse, Analyse ciblée, Analyse non ciblée, Biomarqueurs d’exposition, Biomarqueurs d’effets, Pesticides, Épigénétique, Adduit à l’ADN, ADN, Sang, Urine, Salive, Biosurveillance

Fiche mise à jour en 2025

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