Plateforme de lipidomique fonctionnelle

Expertise et assistance pour la recherche en lipidomique : analyse et caractérisation moléculaire de lipides dans différentes matrices et organismes.

Site de la plateforme

Plateforme de lipidomique fonctionnelle

Expertise et assistance pour la recherche en lipidomique : analyse et caractérisation moléculaire de lipides dans différentes matrices et organismes.

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Plateforme de lipidomique fonctionnelle

La Plateforme de lipidomique fonctionnelle propose à l'ensemble de la communauté scientifique, publique et privée, une expertise et une assistance dans le domaine de l'analyse lipidique. Elle est ouverte à tout type de projets en collaboration ou contractualisés.

La plateforme est équipée d’appareils de chromatographie liquide et gazeuse, ainsi que de spectrométrie de masse pour analyser et caractériser les lipides (lipides structuraux, de signalisation ou marqueurs de peroxydation lipidique) dans diverses matrices (cellules, tissus, organes, urine, plasma, produits laitiers, pollen) et organismes (Homme, animal, insecte, bactérie, levure, plante). Elle conseille et accompagne les scientifiques dans la mise en place de projets en lipidomique, réalise des analyses lipidiques, propose des formations en lipidomique et assure une veille technologique active pour rester à la pointe de l'innovation.

Expertises et services

Analyse et caractérisation moléculaire de lipides structuraux : composition en acides gras des esters de cholestérol, triacylglycérols, phospholipides (classes, sous-classes et espèces moléculaires), stérols et oxystérols,
Analyse et caractérisation moléculaire de lipides de signalisation : métabolites oxygénés issus d’octadécanoïdes (HODE), eicosanoïdes (prostanoïdes, leucotriènes), docosanoïdes (protectines, marésines, résolvines) et diacylglycérols,
Analyse et caractérisation moléculaire de marqueurs de peroxydation lipidique : hydroxy-alkénals (4-HNE, 4-HHE) et isoprostanes.

Moyens et équipements

Chromatographie liquide à ultra-haute performance couplée à la spectrométrie de masse en tandem (UHPLC-MS/MS),
Chromatographie gazeuse couplée à la spectrométrie de masse en tandem (GC-MS/MS),
Appareils de chromatographie liquide (HPLC),
Appareil de chromatographie gazeuse (GC).

<hr>Appareil de chromatographie gazeuse couplé à la spectrométrie de masse (Agilent 7890B/700C).

<hr>Appareil de chromatographie liquide couplé à la spectrométrie de masse (Shimadzu LC-30, Sciex QTRAP 4500).

<hr>Analyses lipidiques dans différents contextes physiologiques et physiopathologiques.

<hr>Analyses lipidiques dans diverses matrices, divers organismes.

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre une demande à la Plateforme de lipidomique fonctionnelle, envoyez un mail à l’adresse plateforme.lipidomique@insa-lyon.fr et décrivez votre projet. L’équipe de la plateforme vous recontactera pour discuter de la faisabilité de votre projet et vous conseiller.

Exemple d'utilisation

Modification du contenu en lipides neutres dans des rétines

Une dérégulation du métabolisme lipidique et du stockage des lipides est associée à une neurodégénérescence dans les pathologies rétiniennes comme la DMLA, ou dans les maladies cérébrales comme Alzheimer. Les lipides sont des composants cellulaires majeurs. Ils peuvent être stockés dans des vésicules appelées « gouttelettes lipidiques » ou LDs. S’il est connu que la fonction des LDs est, en plus de stocker les lipides, de régulater la réponse au stress, l’action protectrice ou toxique de l’accumulation des LDs demeure mal connue.

Pour éclairer ce point, les équipes de Bertrand Mollereau à l’ENS (UMS3444) et de Philippe Brabet à l’Inserm (U1051) ont étudié les conséquences de la modification de la quantité de LDs sur des cellules rétiniennes de souris et de mouches transgéniques. Les résultats ont montré que les LDs dérivées des cellules pigmentaires rétiniennes affectent différemment la viabilité des photorécepteurs dans des conditions pathologiques et physiologiques. Les analyses réalisées sur la plateforme ont mis en évidence une augmentation des esters de cholestérol et des triglycérides dans les rétines des souris transgéniques comparativement aux souris sauvages, alors que les quantités de phospholipides sont restées inchangées.

Pour en savoir plus : Van Den Brink D.M. et al. (2018). Physiological and pathological roles of FATP-mediated lipid droplets in Drosophila and mice retina. PLoS Genetics, 14(9):e1007627.

Contact

Plateforme de lipidomique fonctionnelle
INSA Lyon, bâtiment IMBL
15 avenue Jean Capelle
69621 Villeurbanne
Région : Auvergne-Rhône-Alpes+33 (0)4 72 43 85 74
plateforme.lipidomique@insa-lyon.fr
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