Plateforme d’imagerie commune du site de Luminy (PICsl)

Microscopie optique et électronique pour l’analyse structurelle et fonctionnelle de modèles biologiques et structures subcellulaires à différentes échelles.

Site de la plateforme

Plateforme d’imagerie commune du site de Luminy (PICsl)

Microscopie optique et électronique pour l’analyse structurelle et fonctionnelle de modèles biologiques et structures subcellulaires à différentes échelles.

Site de la plateforme

Plateforme d’imagerie commune du site de Luminy (PICsl)

La plateforme PICsl est hébergée par l’Institut de biologie du développement de Marseille (IBDM) et le Centre d’immunologie de Marseille-Luminy (CIML). Elle est associée à des équipes de recherche et développement de l’IBDM, du CIML et de l’Institut Fresnel.

La plateforme a pour mission de mettre à disposition de la communauté scientifique, locale et nationale, les techniques les plus modernes et innovantes en biophotonique et microscopie électronique. Ses activités comprennent l’acquisition et la gestion d’un parc de microscopes, la formation d’utilisateurs et doctorants sur les équipements de microscopie et logiciels de traitement et d’analyse d’images, ainsi que l’intégration de nouveaux systèmes d’imagerie, non linéaire et à haute résolution, grâce au transfert technologique émanant des équipes de recherche auxquelles la plateforme est adossée.

Le plateau de ressources en imagerie applique une démarche qualité en suivant le référentiel de la norme ISO 9001. La performance et la stabilité des équipements de PICsl sont garantis par un suivi métrologique régulier.

Expertises et services

Microscopie optique photonique :

Microscopie utilisant les méthodes DIC, à contraste interférentiel, par réflexion et génération de seconde harmonique,
Microscopie de fluorescence : plein champ, illumination structurée, confocal, multiphoton et spinning disk,
Videomicroscopie avec contrôle environnemental,
Microscopie à haute résolution STED et PALM/STORM,
Microscopie à illumination par feuillet et lattice lightsheet, soSPIM,
Imagerie dynamique et F-techniques : FRAP, ratiometric-FRET, FCS, FCCS,
Détection de polarisation avec spinning disk,
Analyse d’images sous Image J, Metamorph, ICY, Matlab et Imaris,
Déconvolution et reconstruction 4D avec les algorithmes Huygens,
Stabilisation d’images par indexation sur base de données OMERO.

Microscopie électronique :

Préparation d’échantillons : fixation chimique, haute pression à froid, Tokuyasu...
Étude morphologique de systèmes biologiques par observation en TEM,
Tomographie sur acquisition en microscopie électronique (TEM),
Imagerie corrélative, TEM-PALM /STED,
Microscopie par balayage (SEM) et 3D.

Moyens et équipements

Microscopie photonique :

8 microscopes confocaux : Leica SP5X, Zeiss LSM510, LSM880 Airyscan, LSM880 Fast Airyscan et FLIM,
3 microscopes biphotons : Zeiss 7MP, Zeiss 510 NLO et Leica MP5 OPO,
5 microscopes spinning disks : Roper CSU X1, PerkinElmer CSU X1 avec 2 EMCCD, Visitron CSU X1 avec 2 EMCCD, spinning disk à polarisation développé par le laboratoire,
5 microscopes à feuille de lumière : Zeiss Z1, soSPIM , Ultramicroscope LaVision et 2 microscopes home made,
14 videomicroscopes : 3 apotomes, 2 videomicroscopes avec contrôle environnemental, 8 microscopes et 1 vidéomicroscope à phase,
Microscopes de haute résolution Leica 3D STED avec 2 raies de déplétion (592 et 660 nm) et PALM/STORM home made,
Microscope multimodal FCS avec excitation 1P et 2P (Alba-ISS), détection FLIM,
Scanner de lames 3DHISTECH,
Stations de travail dédiées au traitement d’images : Imaris (3D, tracking), Matlab, Huygens Decovolution, Electron Tomography, Amira, OMERO (base de donées),

Microscopie électronique :

2 microscopes électroniques en transmission : TEM FEI Tecnai G2 avec modules de cryo-imagerie et tomographie, TEM Morgagni 100 kV,
Microscope électronique à balayage FEI SFB-SEM avec système serial block face,
Serveur d'images avec 100 To dédiés à l'imagerie.

<hr>Cellules neurales de souris observées en microscopie confocale après plusieurs marquages. © M. Falque.

<hr>Synapse observée en microscopie électronique à transmission.

<hr>Microscope Zeiss Z1 à feuille de lumière.

<hr>Follicules pileux observés en microscopie optique d’absorption.

<hr>Microscope Zeiss LSM880 Airyscan et FLIM.

<hr>Ovaires de drosophile adulte observés en microscopie de fluorescence. © E. Avazeri.

<hr>Imagerie de fluorescence d’une mitose.

<hr>Neurone sensoriel observé en microscopie de fluorescence.

<hr>Observation en microscopie de fluorescence à illumination structurée. © J. Colombo.

Comment soumettre un projet ?

La plateforme met à votre disposition un matériel à la pointe des avancées technologiques, vous propose un accompagnement à l’utilisation des équipements, ainsi que des formations pour optimiser vos résultats. Pour soumettre une demande à PICsl, prenez rendez-vous avec l’équipe de la plateforme par téléphone ou par mail auprès du responsable scientifique, Pierre-François Lenne. L’utilisation des instruments est facturée à l’heure. Les tarifs sont homologués par le CNRS et peuvent être intégrés dans des demandes de financement.