Plateforme de cytométrie de l’Institut Curie (CYTPIC)

Expertise en cytométrie conventionnelle, spectrale, en image et spatiale pour l’étude des biomarqueurs circulants, des vésicules extracellulaires, des cellules et des tissus.

Site de la plateforme

Plateforme de cytométrie de l’Institut Curie (CYTPIC)

Expertise en cytométrie conventionnelle, spectrale, en image et spatiale pour l’étude des biomarqueurs circulants, des vésicules extracellulaires, des cellules et des tissus.

Site de la plateforme

Plateforme de cytométrie de l’Institut Curie (CYTPIC)

Localisée sur deux sites, à l'Institut Curie de Paris et sur le campus universitaire d'Orsay, la plateforme CYTPIC s’inscrit dans une démarche de coopération interdisciplinaire entre la recherche fondamentale, translationnelle et clinique. Forte d’une expertise variée, elle propose aux chercheurs de l’Institut Curie ainsi qu’aux équipes de recherche externes, académiques et industrielles, un accès à des technologies de pointe dans le domaine de l’analyse single cell.

La plateforme a pour mission d’orienter et de soutenir les projets scientifiques en proposant un panel de service comprenant l’autonomisation par la formation, l’assistance sur les différents instruments, l’accompagnement à la construction des expérimentations, l’optimisation des panels, ainsi que la collaboration, incluant l’analyse des données générées. Afin de couvrir une pluralité d’axes de recherche, elle propose une multitude de technologies : cytométrie en flux conventionnelle, spectrale, en image, scan de lames en simplex et multiplex, protéomique spatiale, détection de biomarqueurs circulants, tri cellulaire, analyse supervisée et non supervisée...

Expertises et services

Analyse phénotypique de biomarqueurs circulants, vésicules extracellulaires, cellules et tissus,
Réalisation d’approches en simplex ou multiplex à la résolution single cell,
Cytométrie conventionnelle, spectrale, en image et spatiale,
Tri cellulaire en bulk, monoclonal ou single cell,
Mise à disposition des équipements et logiciels d’analyse, assistance et collaboration,
Formation pour l’utilisation des instruments et logiciels en autonomie,
Accompagnement à l’élaboration d’expériences : protocole, panel design, instrumentation et analyse des données,
Organisation de workshops, webinaires, séminaires et tutoriels,
Collaboration avec des plateformes complémentaires de l’Institut Curie : NGS, Bioinformatic, Custom single cell omics et Extracellular vesicles.

Moyens et équipements

Analyseurs de cytométrie conventionnelle : BD Fortessa (5 lasers, 18 couleurs), BD Fortesssa X20 (5 lasers, 18 couleurs), Beckman Coulter CytoFLEX LX (5 lasers, 20 couleurs) et Bio-Rad ZE5 (5 lasers, 26 couleurs),
Analyseurs de cytométrie spectrale : Cytek Aurora (5 lasers, 40+ couleurs), Cytek Northern Lights (3 lasers, 27 couleurs),
Analyseurs de biomarqueurs : Luminex BioPlex 200 (2 lasers, 100 tags),
Barcodeur single cell : 10x Genomics Chromium Controller,
Trieurs de cytométrie conventionnelle : BD Aria II (4 lasers, 11 couleurs, 4 voies de tri, cloning/index sorting), BD Aria III (5 lasers, 18 couleurs, 4 voies de tri, cloning/index sorting), BD Aria Fusion (5 lasers, 18 couleurs, 4 voies de tri, cloning/index sorting), Sony SH800 (4 lasers, 6 couleurs, 2 voies de tri, cloning/index sorting),
Trieurs de cytométrie spectrale : Cytek Aurora CS (5 lasers, 40+ couleurs),
Imageur de cytométrie en image : Amnis ImageStream MkII (4 lasers, 10 couleurs, 2 brightfields, 1 darkfield, grossissement 20x, 40x et 60x),
Analyseur de protéomique spatiale : Rarecyte Orion (7 lasers, 20 couleurs, grossissement 4x, 10x, 20x, 40x),
Analyseur de transcriptomique spatiale : 10x Genomics Xenium,
Analyseur de tissus : Hamamatsu Nanozoomer (360 lames, grossissement 20x, 40x).

<hr>Amygdale analysée par cytométrie spectrale spatiale Orion.

<hr>Synapse immunitaire entre une gouttelette lipidique et une cellule B analysée par Imagestream.

<hr>Analyse non supervisée de vésicules extracellulaires dans des population monocytaires.

Comment soumettre un projet ?

Toute prise de contact avec la plateforme s’effectue par mail à l’adresse cytometrie@curie.fr. En fonction de la demande, l’utilisateur est orienté vers le service adapté : utilisation des outils en autonomie, assistance ou collaboration. L’utilisateur s’engage à accepter la charte de la plateforme.

Pour une réservation autonome, il est nécessaire de suivre une formation préalable à l’utilisation de l’instrument ciblé, ouvrant l’accès à un calendrier en ligne. Une réservation assistée se prévoit quant à elle conjointement entre l’utilisateur et un membre de la plateforme, qui veille à orienter le projet vers la technologie adaptée. Le personnel de la plateforme assure le bon déroulement de l’acquisition des données, leur sauvegarde et leur transmission.

Dans le cadre d’une collaboration, la plateforme intervient dans le choix de l’instrument, l’optimisation du protocole, la formation des utilisateurs ou l’acquisition des données, les analyses et la présentation des résultats. Elle participe activement à l’élaboration des articles dont elle est co-auteur, et le projet bénéficie d’un suivi documenté.

Exemple d'utilisation

Analyse par cytométrie en image de la polarité cellulaire à la synapse immunitaire entre une gouttelette lipidique fonctionnalisée et un lymphocyte B

Interface étroite entre une cellule immunitaire et une cellule présentatrice d’antigène (APC), la synapse immunitaire a fait l’objet de nombreuses études au cours des dernières décennies. Mais l’analyse du comportement intracellulaire du contact cellule-cellule est difficile pour des raisons expérimentales. Elle nécessite à la fois un modèle adapté et une plateforme technologique robuste pour imager le contact.

La plateforme CYTPIC a utilisé des lymphocytes B et des gouttelettes lipidiques fonctionnalisées comme modèle in vitro imitant la taille et les propriétés de surface des cellules APC. Elle est parvenue à mettre en évidence et à quantifier de manière exhaustive les conjugués formés entre une seule cellule B et une seule gouttelette de lipide, ainsi qu’à évaluer la polarisation lysosomale intracellulaire. Ce projet mené en collaboration avec l’ENS et l’Institut Pierre-Gilles de Gennes s’est appuyé sur deux technologies de pointe en imagerie intracellulaire : la microfluidique et la cytométrie en image.

Pour en savoir plus : Pinon L. et al. (2022). Phenotyping polarization dynamics of immune cells using a lipid droplet-cell pairing microfluidic plateform. Cell Reports Methods, 2(11):100335.

Contact

Plateforme de cytométrie de l’Institut Curie (CYTPIC)
26 rue d’Ulm
75005 Paris
Région : Île-de-France+33 (0)1 56 24 58 01
cytometrie@curie.fr
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