Plateforme de bioinformatique de Lille (Bilille)

Expertise pour l’exploitation des données en biologie et santé : analyse de données, développement informatique, ressources de calcul, montage de projets, formation et animation scientifique et technique.

Site de la plateforme

Plateforme de bioinformatique de Lille (Bilille)

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Plateforme de bioinformatique de Lille (Bilille)

Bilille est la plateforme de bioinformatique de Lille. Elle fait partie de l'unité PLBS (UAR2014-US41) qui rassemble les plateformes lilloises en biologie et santé. Sa mission première de soutien aux projets scientifiques se traduit par la réalisation d’analyses de données, de développements informatiques (pipelines, bases de données), ainsi que par la mise à disposition de moyens de calcul à haute performance. Sa double expertise en bioinformatique et biostatistique lui permet d'offrir un large spectre de compétences pour l’exploitation de données issues des domaines de recherche en biologie, environnement et santé.

Bilille apporte également son expertise lors du montage de projets collaboratifs, notamment lors de la rédaction des sections méthodologiques des projets, ou de l’évaluation des moyens humains et matériels nécessaires. La plateforme propose par ailleurs des formations régulières à destination de la communauté locale et nationale en bioinformatique et biostatistique pour l'analyse de données. Elle coorganise aussi des journées scientifiques sur diverses thématiques d'actualité.

Expertises et services

Analyse de données omiques (génomique, transcriptomique, protéomique, métagénomique, épigénomique...), de données de criblage à haut contenu et de données d’imagerie,
Biologie intégrative, bioinformatique structurale, phylogénie et biologie des systèmes,
Développement de pipelines d'analyse et de bases de données,
Accompagnement dans le montage de projets collaboratifs,
Formation à la bioinformatique et ses outils,
Mise à disposition de moyens de calcul à haute performance via le cloud,
Animation scientifique et technique.

Moyens et équipements

Moyens de calcul HPC mutualisés (cloud du Mésocentre de l’Université de Lille),
264 cœurs CPU, 2.19 To RAM, 100 To stockage et réseau 10 Gb/s dédié,
96 cœurs CPU, 768 Go RAM intégré à la fédération nationale Biosphère (IFB).

<hr>Salle serveur du Mésocentre de l’Université de Lille, qui héberge les moyens de calcul HPC de la plateforme Bilille.

<hr>Poste de travail équipé à disposition des ingénieurs de la plateforme.

<hr>Rapport d’analyse généré par Bilille pour un projet d’analyse transcriptomique menée sur le parasite Cryptosporidium parvum.

<hr>Bilille est la plateforme de bioinformatique de Lille.

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre un projet, ou en discuter, vous pouvez prendre contact avec la plateforme par mail à l’adresse bilille@univ-lille.fr. Les demandes sont prises en compte en fonction de leur origine et de leur complexité. Les projets de courte durée (1 à 2 mois) et issus du milieu académique lillois bénéficient gratuitement, suivant les disponibilités, d’un temps ingénieur dédié à leur réalisation. Les projets plus ambitieux ou issus du milieu extra-local sont considérés sous condition d’un apport financier. La plateforme propose son accompagnement dès la rédaction des projets pour l’obtention de financements lors d’appels sélectifs.

Les projets sont évalués par un comité scientifique interne, qui s’assure de leur adéquation avec les compétences de la plateforme, ainsi que de la disponibilité des ressources humaines à mettre en œuvre. Le délai nécessaire est précisé à l’issue de cette évaluation, en cas d’acceptation.

L’organisation de formations à la demande est possible pour les entreprises, notamment via CNRS formation entreprises, et pour le monde académique. Le délai d’organisation varie de quelques mois à un an, en fonction du contenu souhaité.

Contact

Bilille
Bâtiment Esprit
Avenue Paul Langevin
59650 Villeneuve-d'Ascq
Région : Hauts-de-France+33 (0)3 28 77 84 41
bilille@univ-lille.fr
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