Infectiologie expérimentale des rongeurs et poissons (IERP)

La plateforme IERP a pour principales missions la production d’animaux à statut sanitaire et génétique défini, la réalisation in vivo d’expérimentations en infectiologie avec des pathogènes variés (virus, bactéries, prions) dans le cadre de recherches en infectiologie, immunologie, vaccinologie, génétique, physiologie ou microbiologie, et le phénotypage par imagerie in vivo de phénomènes complexes en infectiologie.

L’IERP s’étend sur plusieurs bâtiments permettant l’hébergement de différentes espèces : une animalerie de rongeurs (souris et rat), une pisciculture expérimentale pour les espèces aquacoles (truite et carpe) et une animalerie de poissons zèbres. Elle intègre également au sein de ses dispositifs expérimentaux des appareils d’imagerie (IVIS, biphoton).

Actuellement, la plateforme développe un projet pilote pour la production de poissons zèbres à flore contrôlée. Elle s’investit aussi sur la mise au point d’un pipeline de phénotypage immunologique par imagerie de lignées de poissons zèbres pour la construction de cribles génétiques ou à visée thérapeutique, associant édition du génome, phénotypage par imagerie et infectiologie expérimentale. Elle contribue par ailleurs à une étude menée sur l’effet immunostimulant d’aliments expérimentaux (probiotiques, bactériophages...) lors d'une l’infection (flavobactérie) chez la truitelle et à l’analyse des microbiotes associés.

Expertises et services

Expérimentation animale :

• Production d’animaux EOPS (rongeurs et poissons), suivi de lignées génétiquement modifiées (classes 1 et 2) et hébergement en milieu confiné (A2 et A3),
• Elevage en circuit fermé recyclé (CFRT) et pilotage de croissance,
• Elevage d’une quarantaine de lignées de souris transgéniques de classe 1 et 2, dont 16 lignées utilisées pour l’étude des maladies à prions,
• Mise à disposition de truites, poissons zèbres et carpes avec un statut sanitaire et génétique défini (lignées transgéniques, isogéniques et de référence),
• Mise en œuvre de protocoles expérimentaux à divers stades de développement, avec une expertise en inoculation : micro-injection IM, IP, IC, IV (zebrafish et truite), balnéation (modèle d’infection unique pour l’étude des flavobactéries) et transfert d’embryon (souris).

Imagerie du poisson zèbre (zebrafish) :

• Suivi en temps réel de processus infectieux ou de stress inflammatoire en modèle zebrafish et modélisation de pathologies virales aquacoles et humaines,
• Microscopie 3D et 3D+t confocale ou biphoton pour l’imagerie de poissons entiers,
• Immunohistochimie in toto et transparisation de tissus épais (simple immersion, CUBIC, DISCO...), de la larve de poisson zèbre à la truite,  
• Analyse d’images : reconstruction et visualisation 3D, segmentation, quantification, suivi de la dynamique de populations cellulaires (infectées, immunitaires), régénération et cicatrisation de tissus, morphométrie...

Moyens et équipements

Pisciculture expérimentale :

• Zone d’élevage truite avec 4 salles équipées de circuits fermés recyclés thermorégulés (CFTR), 50 000 œufs (incubation) et 30 000 alevins (alevinage) provenant de la Pisciculture expérimentale INRA des Monts d’Arrée (PEIMA),
• Zone d’élevage zebrafish et carpe avec salle équipée de 3 racks, 20 lignées transgéniques et production de 50 000 œufs par an,
• Zone expérimentale pathogène de niveau de sécurité biologique 2 composée d’une salle zebrafish avec 5 racks de 18 aquariums et de 2 salles truite avec 15 circuits pathogènes mixtes (CFRT ou eau perdue), 104 aquariums de 15 litres et 14 bassins de 300 litres, soit près de 10 000 animaux utilisés en zone d’expérimentation.

Animalerie de poissons zèbres :

• Zone SPF avec 2 racks pour le système pilote de production,
• 2 zones conventionnelles avec 6 racks et zone de quarantaine,
• Laboratoires équipés de PSM, postes de micro-injection, stéréomicroscopes…

Imagerie et phénotypage (zebrafish) :

• Microscope statif droit SP8 DM6000 (Leica) avec 3 lasers (405 nm, 488 nm, 552 nm), PMT, détecteurs hybrides, laser IR femtoseconde (680 à 1080 nm), scanner conventionnel et scanner résonant, platine motorisée et chambre thermostatée,
• Stéréomicroscopes MZ10F équipés de fluorescence,
• Postes de micro-injection Narichigue et FemtoJet.

Animalerie de rongeurs :

• Zone protégée d’élevage EOPS avec 2 grandes salles en surpression équipées de portoirs ventilés sous environnement contrôlé (filtration air et eau, stérilisation des aliments, litières et matériels), 48 lignées transgéniques en élevage, 3 200 animaux adultes disponibles et 12 000 naissances par an,
• 2 zones expérimentales (EOPS et conventionnelle) avec 21 cellules et une capacité d’hébergement de 8 500 souris,
• 2 zones expérimentales pathogènes de niveau de sécurité 2 et 3 sous environnement contrôlé (filtration absolue de l’air à la sortie, inactivation des déchets, autoclavage) avec une capacité d’hébergement de 4500 souris,
• Laverie centrale équipée d’automates de lavage,
• Laboratoires de prélèvement, d’inoculation, d’anesthésie et de transfert d’embryons,
• Appareil de bioluminescence IVIS SpectrumBL (PerkinElmer).

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre un projet à l'IERP, vous pouvez remplir le formulaire de contact disponible sur le site de la plateforme ou sur celui de l’infrastructure EMERG’IN. Les informations transmises sont exclusivement destinées au personnel de l'IERP en charge des protocoles expérimentaux et seront traitées dans le strict respect des règles de confidentialité. La plateforme reprendra contact avec vous dès la réception du formulaire.

Exemple d'utilisation

Mise au point et réalisation d’un challenge infectieux

L’équipe de Maria Forlenza à l’Université de Wageningen aux Pays-Bas étudie la virémie printanière de la carpe (VPC). Elle a fait appel à la plateforme IERP pour mettre au point un challenge infectieux par bain sur le poisson, en vue d’évaluer l’efficacité de différents vaccins à ADN et modes d’inoculation, par injection ou voie orale. Le travail des experts a consisté à définir la durée de balnéation (48 heures), la souche du pathogène (VPC 2016-2) et la dose infectieuse. Il a démontré de manière robuste l’effet protecteur de l’un des vaccin testés. 

Pour en savoir plus : Embregts C. et al. (2017). Intra-muscular DNA vaccination against spring viremia of carp virus induces full protection and establishes a viralspecific B and T cell response. Frontiers in Immunology, 8:1340.

Contact

IERP
Centre de recherche INRAE
Domaine de Vilvert
78350 Jouy-en-Josas
Région : Île-de-France+33 (0)1 34 65 25 96
bernard.cayron@inra.fr
Site de la plateforme

THÉMATIQUES : Animalerie, exploration fonctionnelle, Imagerie in vivo, radiobiologie

RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Bernard Cayron (rongeur), Dimitri Rigaudeau (poisson), Christelle Langevin (imagerie)

TUTELLES : INRAE

INFRASTRUCTURES NATIONALES : EMERG’IN

LABELLISATION IBiSA : 2018

MOTS CLÉS : Truites, Zebrafish, Poisson zèbre, Rongeurs, Infectiologie, Immunologie, Génétique, Virus, Bactéries, Circuit fermé recyclé, Zone confinée, NSB2, NSB3, Phénotypage par microscopie, Imagerie in vivo

Fiche mise à jour en 2021

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