Integrative metabolomics for translational and precision medicine (IMPACT-PM)

Située dans le bâtiment EGID sur le campus du CHU de Lille, la plateforme IMPACT-PM est dédiée à la métabolomique basée sur la spectrométrie de masse à haute résolution pour la recherche biomédicale. Sa mission est de caractériser le métabolome dans divers contextes en utilisant la chromatographie liquide ultra-performante (UHPLC) couplée à la spectrométrie de masse à haute résolution (HRMS), en association avec une préparation semi-automatique des échantillons pour une analyse à haut débit, utile tant pour les études de cohortes que pour les études cellulaires.

IMPACT-PM se spécialise dans le profilage et la quantification de petites molécules dans les biofluides, les selles, les tissus, les cellules eucaryotes et d'autres échantillons biologiques complexes. Son expertise permet notamment d’analyser les métabolites microbiens biologiquement actifs produits par le microbiote intestinal, ainsi que de cartographier la diversité chimique des composés dans l’environnement intestinal.

Expertises et services

• Métabolomique globale par UHPLC-HRMS : analyse approfondie des métabolites par le biais d'un profilage ouvert, avec des annotations de haute confiance, grâce à une chimiothèque interne de plus de 2 800 standards purifiés,
• Métabolomique ciblée par UHPLC-HRMS : quantification isotopique des métabolites d’intérêt dans des voies métaboliques spécifiques,
• Métabolomique computationnelle : analyse chimiométrique et bioinformatique.

Moyens et équipements

• UHPLC-HRMS comprenant un spectromètre de masse à haute résolution Orbitrap Exploris 240 couplé à un système UHPLC Vanquish Duo (Thermo Fisher Scientific),
• Automate Janus G3 Standard (Revvity),
• Homogénéisateur Precellys Evolution (Ozyme),
• Évaporateur centrifuge MiVac (GeneVac),
• Serveur de calcul PowerEdge R750 avec 2 cartes GPU (Dell),
• Serveur de stockage PowerScale H700 (Dell).

Comment soumettre un projet ?

Pour soumettre une demande à la plateforme IMPACT-PM, vous pouvez envoyer un mail à l’adresse impact-pm@univ-lille.fr, en incluant tous les détails pertinents concernant votre projet. Après évaluation de sa faisabilité, le projet sera validé en interne. Vous recevrez alors un relevé d’activités détaillant les étapes suivantes. Dès la réception des échantillons, les analyses seront lancées conformément aux modalités définies.

Exemple d'utilisation

Analyse des effets de l’hippurate sur le métabolisme d’hépatocytes humains

Un projet impliquant la plateforme IMPACT-PM a consisté à réaliser un profilage global des hépatocytes humains immortalisés (IHH) par UHPLC-HRMS dans le but d’examiner les effets de l’hippurate sur leur métabolisme. Une approche de métabolomique ciblée a également été mise en œuvre pour quantifier l’absorption de l’hippurate par les cellules IHH. Ces travaux ont fait l’objet d’une publication dans la revue Molecular Metabolism.

Pour en savoir plus : Deslande M. et al. (2025). Intrahepatic levels of microbiome-derived hippurate associates with improved metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease. Molecular Metabolism, 92:102090.

Contact

IMPACT-PM
EGENODIA, U1283, UMR8199
Université de Lille, Pôle Recherche
1 place de Verdun
59045 Lille
Région : Hauts-de-France+33 (0)3 20 62 34 03
impact-pm@univ-lille.fr
Site de la plateforme

THÉMATIQUES : Métabolomique, exposome

RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Marc-Emmanuel Dumas

RESPONSABLES TECHNIQUES :
Inés Castro

TUTELLES : CHU de Lille, CNRS, Inserm, Institut Pasteur, Université de Lille

INFRASTRUCTURES NATIONALES : MetaboHUB

LABELLISATION IBiSA : 2024

MOTS CLÉS : Métabolomique globale, Métabolomique ciblée, Spectrométrie de masse à haute résolution, Chromatographie liquide à ultra haute performance, Échantillons biologiques, Métabolites microbiens, Analyse bioinformatique, Analyse chimiométrique, Chimiothèque, Études cliniques, Modèles précliniques

Fiche mise à jour en 2025

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