iGenSeq
Tout pour le séquençage à haut débit, du design des projets à leur réalisation, jusqu'à la fourniture des fichiers fastq.
iGenSeq
Tout pour le séquençage à haut débit, du design des projets à leur réalisation, jusqu'à la fourniture des fichiers fastq.
iGenSeq
iGenSeq est une plateforme technologique ouverte aux laboratoires académiques, aux services hospitaliers et aux partenaires industriels. Localisée à l’Institut du cerveau (ICM) sur le site de l’Hôpital de la Pitié-Salpêtrière à Paris, elle fournit à ses utilisateurs des outils et services pour l’analyse des acides nucléiques.
Créé en 2011 à l’ouverture de l’Institut, la plateforme s’est spécialisée dans les prestations de séquençage à haut débit et a évolué pour répondre aux projets de pointe en génomique. Son équipe est composé de 7 personnels permanents, garantissant la pérennité de son savoir-faire et de son expertise. Tous les membres d’iGenSeq sont formés à l’ensemble des activités de la plateforme afin de maintenir la continuité permanente des services proposés.
Expertises et services
- Réalisation de génomes (toutes espèces) et d’exomes (humains et souris),
- Methyl-Seq, ChIP-Seq, ATAC-Seq, CLIP-Seq, Cut&Tag-Seq à partir d’acides nucléiques purifiés,
- RNA-Seq (3’, low input, FFPE, mRNA, ribodepletion) et small RNA-Seq,
- Analyse sur cellule unique (single cell),
- PCR en temps réel (qPCR) à haut débit et PCR digitale en gouttelettes,
- Identitovigilance pour la sécurisation des données des patients,
- Accompagnement sur le design de projets,
- Mise à disposition des équipements.
Moyens et équipements
- Séquenceurs NovaSeq 6000, NextSeq 500 et MiSeq (Illumina),
- Chromium Controller (10x Genomics),
- LightCycler 96 et 384 (Roche),
- Biomark HD (Fluidigm),
- Droplet Digital PCR (Bio-Rad).
Comment soumettre un projet ?
Pour soumettre un dossier ou un projet à iGenSeq, vous pouvez passer par le site web de la plateforme ou vous adresser directement à son responsable, Yannick Marie.
Contact
iGenSeq
Institut du cerveau (ICM)
Hôpital de la Pitié-Salpêtrière
47 boulevard de l’Hôpital
75013 Paris
Région : Île-de-France
yannick.marie@icm-institute.org
Site de la plateforme
THÉMATIQUES : Génomique, transcriptomique
RESPONSABLES SCIENTIFIQUES :
Stéphanie Baulac
RESPONSABLES TECHNIQUES :
Yannick Marie
RESPONSABLES QUALITÉ :
Laurine Lenoir
CERTIFICATIONS :
TUTELLES : CNRS, Inserm, Sorbonne Université
INFRASTRUCTURES NATIONALES : France Génomique
LABELLISATION IBiSA : 2021
MOTS CLÉS : NGS, Séquençage haut debit, Single cell, Illumina, Préparation de librairies, Ready to seq, Ready to load, Short reads, ARN, ADN, NovaSeq 6000
Fiche mise à jour en 2022
