Biomics

Structure dédiée à l’autonomisation et à la prise en charge complète de projets de séquençage de seconde (short-reads) et de troisième génération (long-reads).

Site de la plateforme

Biomics

Structure dédiée à l’autonomisation et à la prise en charge complète de projets de séquençage de seconde (short-reads) et de troisième génération (long-reads).

Site de la plateforme

Biomics

Biomics a pour mission de faciliter la découverte scientifique au travers des technologie de séquençage à haut débit. Pour cela, la plateforme propose un accompagnement personnalisé, depuis la formation aux différentes méthodes de séquençage comprenant l’utilisation de séquenceurs en autonomie, jusqu’à la prise en charge complète des projets les plus complexes, de la préparation de l’échantillon à l’analyse des données. Biomics réalise également des projets de développement en interne pour pouvoir continuer à proposer les dernières avancées en matière de séquençage.

Expertises et services

Pour eucaryotes, procaryotes et virus :

Séquençage : short reads (Illumina) et long reads (PacBio et Nanopore),
DNA-Seq : séquençage de novo et ciblé,
RNA-Seq : analyse transcriptionnelle,
Métagénomique : étude par séquençage ciblé (16S, 18S, ITS) ou aléatoire (shotgun),
Bioinformatique : analyse de données de séquençage (variant, assemblage, études de méthylation…).

Moyens et équipements

Contrôle qualité et préparation de librairies :

BioAnalyzer*,
QuBit*,
Covaris*,
Fragment Analyzer,
Blue Pippin.

Séquençage short reads :

Illumina ISeq 100*,
2 Illumina MiSeq,
2 Illumina NextSeq*,
Illumina HiSeq 2500 (arrêt prévu en 2020).

Séquençage long reads :

PacBio Sequel,
Nanopore Minion.

Génotypage (array) :

Iscan*,
Tekan*.

* Utilisation en autonomie après formation.

Comment soumettre un projet ?

La soumission d’un projet se fait uniquement sur le site web de la plateforme. Vous pouvez poser des questions avant de déposer votre demande. Après soumission, tout ou partie des étapes suivantes seront exécutées : demande d’informations complémentaires, attribution d’un gestionnaire Biomics, kick-off meeting, établissement d’un devis, réception des échantillons et contrôle de leur qualité, préparation des librairies et séquençage, contrôle qualité des séquences, analyse bioinformatique.

Le temps de traitement des projets varie avec leur complexité. Il est généralement de 4 à 12 semaines. Biomics propose aussi des formations pour utiliser le matériel de la plateforme en autonomie et réaliser toutes les étapes d’un projet de séquençage classique en une semaine.