CRB du CHU de Nantes

Préparation et conservation d’échantillons biologiques humains pour les médecins, scientifiques, laboratoires pharmaceutiques et biotechnologiques intervenant sur des projets de recherche en santé.

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Le CRB du CHU de Nantes a pour mission de gérer des biocollections afin de fournir des matières premières de qualité aux équipes de recherche et de participer à l’excellence de leurs projets scientifiques. Il accompagne les chercheurs dans l’élaboration de biocollections répondant à leurs besoins, tout en veillant aux droits des personnes et aux exigences réglementaires.

La structure s’appuie sur les compétences d’une équipe d’ingénieurs et de techniciens de laboratoire formés à des techniques de préparation et de stockage d’échantillons à de très basses températures pour une conservation sécurisée et à long terme. Chaque échantillon bénéficie d’une traçabilité, depuis sa réception jusqu’à sa sortie du CRB.

Plurithématique et dédié à la recherche, le CRB évolue constamment vers de nouvelles techniques de préparation pour suivre les progrès de la science. Il est également engagé dans l’amélioration continue de ses pratiques.

Expertises et services

Préparation et congélation d’échantillons à partir de prélèvements frais : aliquotage de fluides (sang, sérum, plasma, urine) et de selles, isolement de PBMC et buffy coat, tri immunomagnétique de sous-populations cellulaires, congélation cellulaire en DMSO, RLT, Trizol, culots sec et par palliers (tubes PAXgene),
Extraction et dosage spectrophotométrique d’acides nucléiques : ADN génomique (culots cellulaires, prélèvements sanguins ou buccaux), ARN (prélèvements sanguins, tubes PAXgene) et ADN de microbiotes bactériens (selles, urine),
Hébergement d’échantillons déjà préparés : inventaire, vérification de l’étiquetage, stockage et conservation sécurisée à diverses températures,
Gestion des données associées aux échantillons,
Participation à des cohortes et des essais cliniques,
Distribution des ressources du CRB avec l’accord des responsables des biocollections.

Composition des collections

Échantillons représentatifs de pathologies humaines :

Plus de 600 000 échantillons de sang, sérum, plasma, lait, salive, urine, selles, écouvillons, biopsies, LCR, LBA, ADN et ARN,
Plus de 150 collections liées aux pathologies du système cardiovasculaire, digestif, endocrinien, immunitaire, lymphatique, nerveux, respiratoire, urinaire, ou aux maladies infectieuses et pédiatriques : troubles du rythme cardiaque, maladies inflammatoires chroniques de l'intestin, hypercholestérolémies, dermatites atopiques, maladies du sang, addictions, transplantations pulmonaires et rénales, mort inattendue du nourrisson...

<hr>Vérification de l’étiquetage de prélèvements arrivés congelés.

<hr>Enregistrement de prélèvements à réception.

<hr>Prélèvements sanguins pour la préparation d’échantillons d’ADN ou ARN, de PBMC, plasma ou sérum.

<hr>La centrifugation permet par exemple de séparer les hématies, les leucocytes et le plasma d’un prélèvement sanguin.

<hr>Isolement de PBMC après séparation sur gradient de Ficoll.

<hr>Laboratoire de biologie moléculaire pour l’extraction des acides nucléiques.

<hr>Dosage spectrophotométrique d’extraits d’acides nucléiques.

<hr>Cuves d’azote liquide à remplissage automatique pour la conservation de cellules en DMSO.

<hr>Ligne sous vide pour l’acheminement de l’azote liquide jusqu’aux cuves à remplissage automatique.

<hr>Réactifs pour la congélation de cellules.

<hr>Salle des congélateurs à -25°C ou -80°C, surveillés 24h/24.

<hr>Congélateur à -80°C pour la conservation des échantillons.

Comment accéder au CRB ?

Les modalités d’accès aux prestations du CRB de Nantes et aux biocollections sont décrites dans la charte d’utilisation du CRB publiée sur son site internet. Pour toute demande, vous pouvez envoyer un mail à l’adresse crb@chu-nantes.fr.

Pour la constitution d’une nouvelle biocollection, le responsable opérationnel du CRB procédera à une évaluation de la faisabilité technique, réglementaire et financière de votre projet. Si la collection est sous la responsabilité réglementaire et financière d’un autre établissement que le CHU de Nantes, un contrat de prestation ou de collaboration sera signé avant la mise en œuvre opérationnelle de la collecte des prélèvements.

Pour un accès à des ressources biologiques, le responsable opérationnel du CRB vous mettra en relation avec l’initiateur et responsable scientifique de la biocollection concernée. Avec son accord, un contrat de mise à disposition des échantillons et des données associées pourra être signé sur la base des échantillons qu’il aura sélectionnés avec vous. La composition des collections hébergées par le CRB est détaillée sous la forme d’un catalogue en ligne mis à jour régulièrement.

Exemple d'utilisation

Gestion de la biocollection adossée à la cohorte DIVAT

DIVAT est une base de données utile aux études cliniques et épidémiologiques menées sur les transplantations. Elle permet le suivi des données médicales d’une cohorte de patients transplantés du rein ou du pancréas. Huit centres français y contribuent. Le CRB du CHU de Nantes accompagne notamment l’Institut de transplantation urologie-néphrologie (Itun) de Nantes dans la gestion des échantillons de la biocollection de la cohorte adossée au projet.

Pour en savoir plus : DIVAT : Données informatisées et validées en transplantation.

Contact

CRB du CHU de Nantes
Institut de biologie
9 quai Moncousu
44093 Nantes Cedex 1
Région : Pays de la Loire+33 (0)2 53 48 22 02
crb@chu-nantes.fr
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