Centre national de ressources génomiques végétales (CNRGV)

Conservation, caractérisation et valorisation de ressources génomiques végétales.

Site du CRB

Centre national de ressources génomiques végétales (CNRGV)

Conservation, caractérisation et valorisation de ressources génomiques végétales.

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Centre national de ressources génomiques végétales (CNRGV)

Le CNRGV est à la fois un CRB qui centralise un large panel de ressources génomiques végétales de plantes modèles et cultivées, et une structure d’appui aux projets de recherche en génomique végétale. À ce titre, il propose aux laboratoires publics et aux entreprises privées des outils et des protocoles innovants pour caractériser les bases génomiques de la diversité des plantes, ainsi que les mécanismes qui gouvernent leur croissance et leur permettent de s’adapter aux stress biotiques et abiotiques.

Grâce à son expertise en génomique des plantes, le CNRGV développe des stratégies de caractérisation à l’échelle des génomes entiers, telles que les cartes optiques, et des méthodes innovantes de captures de régions ciblées. Il met en œuvre des outils de bioanalyse pour accompagner ces méthodes en intégrant différents types de données génomiques. Ces outils offrent des solutions intégrées et complètes aux équipes de recherche dans un cadre collaboratif.

Expertises et services

Conservation de ressources génomiques végétales validées,
Criblage et distribution d’échantillons issus de ces ressources,
Production de ressources génomiques végétales à façon,
Extraction de l’ADN de plantes,
Capture de régions génomiques d’intérêt,
Cartographie optique de génomes.

Composition des collections

Ressources génomiques végétales :

315 collections d’ADN végétal cloné (BAC) représentant 29,3 millions d’échantillons,
45 espèces végétales, espèces modèles et cultivées représentées.

<hr>Plugs contenant des noyaux d'ADN végétal.

<hr>Segment d'une carte optique de génome.

<hr>Stockage de banques génomiques à -80°C.

Comment accéder au CRB ?

Les ressources et services du CNRGV sont répertoriées sur le site internet du CRB. Pour les requêtes les plus simples, comme une demande d’échantillons ou de collections, il est possible de passer commande directement sur le site. Pour les services plus complexes, le site internet permet de formuler les besoins en vue d’une discussion qui permettra de définir les attentes et de proposer des solutions adaptées. Une réponse sera apportée dans les 8 jours suivant la demande. Les activités prévues feront ensuite l’objet d’un devis et d’un contrat. À l’issue du projet, un retour d’expérience sera proposé afin de mesurer la satisfaction du demandeur.

Exemple d'utilisation

Utilisation de banques BAC pour caractériser la résistance du maïs au mildiou

Le CNRGV a été partenaire d’un projet international visant à caractériser la résistance au mildiou chez le maïs. Ce travail impliquant des équipes de recherche publiques et un partenaire privé, a consisté à comparer la diversité allélique de gènes de résistances au mildiou parmi 5 génotypes de maïs.

Une stratégie basée sur le séquençage des génomes de ces 5 variétés a été envisagée, mais elle aurait été coûteuse et aurait exigé la mise en œuvre de méthodes d’analyse très complexes. Le CNRGV a proposé une solution alternative basée sur les banques BAC, permettant d’isoler les régions des génomes contenant les gènes d’intérêt, de les séquencer pour un coût réduit et de comparer facilement leurs séquences. Ce travail qui illustre l’intérêt des banques BAC a donné lieu à une publication.

Pour en savoir plus : Ping Y. et al. (2021). Alleles of a wall-associated kinase gene account for three of the major northern corn leaf blight resistance loci in maize. The Plant Journal, 106(2):526-535.

Contact

CNRGV
24 chemin de Borde Rouge - Auzeville
31326 Castanet-Tolosan Cedex
Région : Occitanie+33 (0)5 61 28 55 62
infocnrgv-toulouse@inrae.fr
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